摘要：目的了解云南省蛛蝇和蝠蝇中沃尔巴克氏体(Wolbachia)的感染状况及其基因型别。方法 2012-2017年,在云南省芒市、腾冲、畹町、孟连、勐腊、祥云、墨江、永德县和保山市隆阳区共9个采样点采集蝙蝠体表蛛蝇和蝠蝇,PCR扩增沃尔巴克氏体的核糖体小亚基16S(16S rRNA)和细菌表皮蛋白(wsp)基因并测序,对所有16S r RNA和wsp基因进行系统进化分析。结果 2012-2017年,在云南省9个采集点采集蝙蝠体表蛛蝇747只(48批)和蝠蝇19只(6批),检测54批标本获得沃尔巴克氏体16S rRNA和wsp基因序列各24条。云南省蝙蝠体表蛛蝇和蝠蝇中,蛛虱蝇属(Phthiridium)6批和Eucampsipoda属37批中检出沃尔巴克氏体阳性分别为2批(2/6)和19批(19/37),蛛虱蝇属(Nycteribia)(0/4)和笔虱蝇属(Penicillidia)(0/1)未检出;蝠蝇均属于蝠虱蝇属(Brachytarsina),6批中检出沃尔巴克氏体阳性的有3批(3/6)。16S rRNA基因系统进化结果提示,24株沃尔巴克氏体均位于一个大的分支中,与1株来源于白蚁(DQ837204)的同源性最高达98.80%~100%。wsp基因的系统进化分析提示,24株沃尔巴克氏体位于B组和F组基因型。结论沃尔巴克氏体在云南省蛛蝇和蝠蝇中广泛而长期存在,wsp基因系统进化分析属于B组和F组基因型。