计算生物学分析在基因组编辑研究中的应用

作者:王滢; 熊义春; 陈佳; 杨力 中国科学院计算生物学重点实验室、中国科学院-德国马普学会计算生物学伙伴研究所、中国科学院上海生命科学研究院营养与健康研究院; 中国科学院大学; 上海200031; 上海科技大学生命科学与技术学院; 上海200031

摘要:基因组编辑是对基因组遗传信息进行定向改造的技术,其中CRISPR/Cas系统是目前应用最广泛的基因组编辑新技术。将先进的高通量测序以及相关计算生物分析应用于基因编辑研究,可进一步优化基因编辑效率和精度等检测流程,实现对全基因组功能基因筛选的监测。同时,利用基于生物信息及机器学习和深度学习等新方法,可对向导RNA(gRNA)的高效设计和实现对编辑效果的预测。本文将对计算生物学分析在CRISPR/Cas基因编辑系统的应用及研究进展等进行概述。

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