应用转录组和外显子组测序分析不同年龄组的胶质母细胞瘤中基因表达与突变的差异

作者:王志刚; 刘伟 中国医学科学院基础医学研究所医学生物工程学系; 中国医学科学院基础医学研究所人体解剖学与组织学胚胎学系; 北京100005

摘要:目的探讨通过转录组和外显子组测序分析不同年龄组的胶质母细胞瘤的差异。方法多形性胶质母细胞瘤(GBM)数据下载自TCGA项目。将样本分为2组,不高于60岁的样本为中低年龄组,共78例;高于60岁的样本为高年龄组,共76例。使用R语言DESeq2软件包对RNA-seq原始基因水平的reads数目数据进行差异表达分析。使用Cytoscape插件Clue GO进行不同年龄组别差异表达基因功能富集分析。结果 GBM致病基因在两组之间大部分基因表达趋势一致,但存在差异基因。在中低龄组中差异基因主要和神经前体细胞增殖相关,而高年龄组偏重于代谢方面。在两组中高突变的基因有很多重叠。样本突变率不同的基因主要为中低年龄组特有,且具有高样本突变率的基因。结论中低年龄组和高龄组GBM患者在基因表达和基因突变上存在明显差异。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

解剖学报

北大期刊 下单

国际刊号:0529-1356

国内刊号:11-2228/R

杂志详情
相关热门期刊
  • 应用写作
    北大期刊 下单

    国际刊号:1003-3602

    国内刊号:22-1045/H

  • 应用激光
    北大期刊 下单

    国际刊号:1000-372X

    国内刊号:31-1375/T

  • 应用科技
    北大期刊 下单

    国际刊号:1009-671X

    国内刊号:23-1191/U

  • 应用化工
    北大期刊 下单

    国际刊号:1671-3206

    国内刊号:61-1370/TQ

服务介绍LITERATURE

正规发表流程 全程指导

多年专注期刊服务,熟悉发表政策,投稿全程指导。因为专注所以专业。

保障正刊 双刊号

推荐期刊保障正刊,评职认可,企业资质合规可查。

用户信息严格保密

诚信服务,签订协议,严格保密用户信息,提供正规票据。

不成功可退款

如果发表不成功可退款或转刊。资金受第三方支付宝监管,安全放心。