时间：2022-06-09 20:03:03
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专业基础课的设置体现了从科学、技术到工程的循序渐进过程（见表1）。然而从科学到技术的差异很小，仅增加了工程基础课4学分（约11%），应为技术基础课，且应明确例举。从技术到工程的专业基础课要求有了明确的变化，按课程类别从科学到工程变化率近50%。学分的控制宜统一，且应规定生物技术专业的专业基础课最低学分要求中技术基础课学分应达20%以上，生物工程专业的专业基础课最低学分要求中工程基础课学分应达40%以上。且可给出典型的工程类专业基础课名录，如机械零件、电子电工基础等课程。另外生物工程专业基础课将《机械设计基础》列为可有可无的选修会造成该专业工程基础的严重缺陷，且应在生物工程专业的专业选修课中保留生物技术专业的细胞工程、酶工程等选修课（见表1）。
二、专业课
专业课的设置也体现了从科学、技术到工程的循序渐进过程（见表1），从科学到技术的专业课调整率达30%，而从技术到工程的专业课虽然有较大变化，但所列举的课程多为非典型的工科专业课（如基因工程、细胞工程、蛋白质工程），回避了典型的工科专业课如氨基酸工艺学、抗生素工艺学、有机酸工艺学、酿造酒工艺学等。学分的增加也不尽合理，三个相近专业，不论理科还是工科，学分基本要求应尽可能一致。向上浮动及在各选修课程间适当调整则是各校应有一定的自。另外生物工程是典型的工艺类专业，专业必修课缺工艺类专业应有的分析检测课也会给工艺过程及产品研发和生产中的质检质监和质控及产品安全留下隐患，故建议3+X模式中3应包含专业分析、X应例举氨基酸工艺学、抗生素工艺学、有机酸工艺学、酿造酒工艺学等。
三、实习及毕业实践环节
生物科学和生物技术的实习及毕业实践环节完全一致（见表1），未能体现从科学到技术的差异特点以及生物技术可授农学或林学学位的特色。毕业设计是工科工艺类专业最为特色的实践环节，但在许多学校以“毕业设计（论文）”的形式出现，实际实施则只做毕业论文，没有毕业设计，使毕业设计名存实亡，致使许多学校生物工程专业的毕业生根本就不知道何谓毕业设计，许多学生甚至把毕业论文当作毕业设计。建议明确生物工程专业的“毕业设计”为必修环节，可以设计论文二者兼顾，至于是“大设计小论文”还是“大论文小设计”可依各校情况而定，唯有如此，生物工程专业才能名符其实。
四、师资要求
师资的最低要求在规范中描述不尽一致，应加以统一。且应规定专业课的师资要求，因为能承担专业课的老师一般能胜任专业基础课，而能承担专业基础课的老师则不一定能胜任专业课。这在工科尤其如此。故除规定学历职称要求外，应规定专业要求，即“本科为相应或相关专业”的师资应大于专业师资总数的50%。
五、其他
构建了以实验教学和课程设计为基础，实习和实训为核心，社会实践和科研创新活动相结合的实践教学新体系．理工并重，产、学、研有机结合，全面提高学生的创新能力和实践应用能力．
1.1改革实验课程体系，构建新的实验教学方式受重理论、轻实践传统教学思想影响，实验教学以教师为主导，学生没有真正融入教学过程．对此，建立了以学生为主体的实验教学方式，采用启发式和引导式教学，培养学生问题意识，形成积极的思维方式，促使学生有目的、自主地进行实验操作，在实践中寻找解决问题的方法，提高实验技能．将多媒体引入实验教学，使整个教学过程更加直观、具体．1.1.1加大综合性、设计性实验比例传统实验教学中以简单的验证性实验为主，内容分散、陈旧．综合性、设计性实验开出率低，不利于学生综合能力的提高．为此，加大涉及多学科、多因素的综合性实验，以及由学生自行设计实验方案的设计性实验，减少验证性实验，促进学生知识、能力和素质的全面提高．如生物工程专业设置的“DNA的重组、转化及筛选”综合性实验，全面综合了从目的基因获得、重组、转化及筛选的整个DNA重组技术的原理和操作．此外，开设的生物技术大实验，综合了天然药化、生化工程等实验课程，解决了专业实验课程内容重复、衔接不当等问题．设计性实验是对综合性实验的进一步提升，强调自主性，为学生提供了更大的发挥空间．为进一步提高实验综合性，实施了模块化实验教学．结合生物工程产业发展趋势，整合多门实验课，将实验分为三大模块：以产品的提取、分离为主的生化工程模块，以微生物发酵为主的发酵工艺模块及以DNA重组及表达为主的基因工程模块．减少了实验门数，强化知识的衔接和融合，全面促进了学生综合能力的提高．1.1.2构建多层次、立体化的开放性实验教学改革传统的实验教学方式，构建开放性实验教学模式是提高学生实践动手能力和综合应用知识能力的重要途径．开放性实验教学是以能力培养为核心，以学生为主体，变被动学习为主动学习，提高学生综合素质的一种教学体系．其教学模式包括时间开放和空间开放（实验室场所，资源开放），也包含开放式的实验教学方式．实行分层次开放性实验教学，将实验内容分为基础型、提高型和研究创新型，循序渐进地提高学生全面素质．
1.2加强实践教学，加大实训、实习基地建设
生物工程专业是为实际生产服务，其特点是实践应用性强．实验室教学具有其局限性，它与实际生产存在较大距离．因此，培养工程实践人才，应加强实践教学环节，建设良好的实习和实训基地．以社会和市场需求为导向，以专业技能训练为主要目标，构建了面向生产实际的，集技能实训、工艺设计、产品研发于一体的任务驱动式综合化实践教学体系．为解决实践教学基地不足的问题，与多家企业、工厂建立合作关系，成立多个校外实践基地．校企合作是使学生接触生产实际的有效途径，克服了传统办学模式中人才培养与社会需要相脱节的现象．学生通过深入生产一线，熟练大型设备操作，掌握基本生产流程，增强了工程意识，提高了实践应用能力和创新能力．因此，应进一步实行校企联合，通过结合企业最新研究及发展方向，确定专业技术课程和技能实训模块，使教学更具实践性，培养学生理论知识转化为实际生产力的意识和能力．此外，校企共建技术中心共同研究开发课题，加速了科技成果的产业化，促进了学校与企业共同发展，推动了区域经济建设．
1.3实行双师型教学
建立“双师型”师资队伍．聘请企业高级技术人才作为兼职教师，激励教师到企业学习，建立高素质的教学师资队伍．使学生了解企业运行机制，巩固理论知识，提高工程素质．
2将科研引入教学，培养学生创新能力
科研带动了生物工程行业的发展，没有科研就没有创新．培养学生创新能力的关键是使学生掌握科学研究的思想和方法．教不研则枯，科研融入教学，有利于及时地将新技术、新知识注入实验教学，培养学生积极主动的探索精神，激发创新思维．
2.1引入科研课题
将教师的科研课题引入实验课或毕业论文的选题中．教师给定实验的目的与要求，由学生根据实际条件，查阅文献并制定实验方案，由指导教师核定后实施．
2.2建立创新实验室，设立专项科研基金
建立本科创新实验室，为学生的研究设想提供理想的平台，充分调动了学生的自主性，培养学生的创新思维．通过设置大学生创新项目基金，为创新实验提供经费支持．该项目由学生自主申请、组织开展课题研究．对于结题及取得良好成果的采取记学分、奖励等措施，激发学生积极性．这种探索性科学研究，培养了学生分析与综合、抽象概括、归纳演绎等科学的思维方法，提高了学生创新能力，已有一些成果在高水平的科学杂志上发表．
2.3实行大学生导师制
从低年级开始，由学生根据自己的兴趣，选择导师及研究方向．通过加入教师的课题，在导师指导下开展实验研究，培养学生的科学精神和科学素养．导师制为学生提供宝贵的智力资源，学生可以自由地与高层次的科研人员进行学习交流，实现了因材施教，有利于学生积极性的提高及个性发挥．科研训练环节作为高层次实验教学环节，是实现培养创新型人才目标与定位不可缺少的途径．由科研一线教师担任指导老师，对学生进行科研训练，提高学生的科研能力，是创新型人才培养的一个特色．
2.4开放科研实验室
高校科研实验室是高校科学研究、学术交流和产品研发的重要场所，是科研成果和创新思想的重要产地．为充分利用科研实验室的资源优势，对其实施开放，将科研实验室融入本科教学，构建科研与教学有机结合的创新人才培养模式．资源生物重点实验室开放以来，激发了学生创新能力，提高了学生操作技能，使学生形成了良好的科研素质．此外，深化教学管理制度的改革，优化教学过程控制，是提高教学效果的保障．为此，建立了以能力考核为核心，多元化的、全面的考核评价体系．加强过程考核，使学生注重平时的学习和实验操作．把学生的发展情况作为衡量教学成果的主要标准、突出创新和应用能力的评价，全面考核学生的综合素质．
3结语
1.指导教师监控机制
学生能否按规定的要求，保质保量地完成毕业论文任务，指导教师起到核心监控作用。教师的知识结构、学术水平、教学经验、工作作风、工作责任心等，都对毕业论文指导效果发挥影响。指导教师应有曾经独立指导或协助指导过毕业论文工作经验，在以往指导毕业论文过程中认真负责、学生反映良好、毕业设计完成较好。生物工程专业属于理工科，除了有良好态度外，还要求指导教师有较高的科研素养。
2.选题监控机制
为了较好地开展毕业论文选题工作，在第七学期教师应该下达关于毕业论文选题的工作。学生可以结合教师的科研选题，学生确定后，指导教师介绍课题的基本要求，并提供一部分资料。学生自行选题，学生根据实际工作或者实习情况，对未来所从事的工作有明确想法，对未来工作有应用价值,可以进行这个方面的研究选择，但指导教师必须严格控制，学生必须写出提纲和内容摘要，明确研究目的方向。生物工程专业毕业生选题来源也无非这几个方向，对于重实验、重数据的专业来说，更是需要在选题的时候把控好方向。
3.开题监控机制
开题环节是做好毕业论文工作重要部分，督促学生完成好开题报告能够控制意外的发生。课题内容是否适合学生的能力，能够在规定时间完成，选题是否存在过大或者过窄，是否需要更换题目，通过审查开题报告内容发现研究路径和方法是否合理。论文结构是否恰当。这个环节做充足，能够减少重大失误，提醒学生在研究课题过程中应注意的问题和环节，对研究困难有一定预见性。生物工程的毕业生更是应该在这个环节做充分准备。
二、生物工程专业论文中期质量监控
重点监控毕业生参加毕业论文的态度、自觉性，时间与精力是否有保证等。由指导教师组织、安排，要求毕业学生汇报课题进展情况，回答指导教师提出的问题，对毕业论文中存在态度问题的学生及时进行批评、警告，及时指明努力方向，采取补救措施。任何专业都需要强调毕业生个体的努力，对于毕业生的学习风气应该常抓不懈。
三、毕业论文后期质量监控阶段
1.论文答辩前监控
院系检查学生是否按毕业论文要求完成所有工作，对学生成果验收和答辩资格审查，确定学生答辩资格。毕业论文成绩一般采用五级计分制：优秀、良好、中等、及格、不及格。指导教师、评阅教师对学生的论文进行评定。指导教师主要关注选题意义、材料选择及组织能力、结构框架、基础理论的运用及分析能力、论文的学术水平等；评阅教师主要关注选题意义、论文难度、结构、资料使用、论述、运用能力等方面，只有指导教师和评阅教师给出的成绩达到及格，才能进行答辩。
2.论文答辩过程监控机制
1.相应的学科应该与学校转型相适应
在进行学院转型和专业教学改革的过程中，需要遵循重要原则是相应的学科与学校转型相适应，首先各个专业教学的改革要与学校转型的程度相一致，只有这样具体的专业调整才能够和学校相适应，有效地借助于院校的优势进行专业教学的改革。另外，学科的发展和改革离不开学校转型的帮助，只有遵循学校转型的规划和方向，才可以实现有效的学科规划。总而言之，两方面都是息息相关、相辅相成的，只有两者积极配合，才能够实现有效的教学改革和教学实践。
2.学生特点与专业改革相融合
在进行教学转型和教学改革过程中，还要能够实现学生特点和专业改革的融合。因为学生是教学的主体，无论是专业教学还是院校的转型，学生永远是这些活动的中心。如果学生无法适应这些教学的改革，无论改革理念有多么先进，这些改革注定是要失败的。所以，在进行教学改革和教学转型时，必须要实现学生与教学的一致，实现学生能力、学生特点与教学理念、教学改革的相统一，只有如此，才能让后续的工作按照既定的方向和目标进行下去。
二、生物工程专业在教学转型过程中存在的问题
1.学科定位、专业设置不够合理
生物工程专业在教学过程中出现的一个突出问题是学科定位、专业设置不够合理，这阻碍了教学的进步。地方院校生命科学院设置的生物工程专业的课程设置、学生数量、就业状况、存在的问题，课程比例不协调，一般课程和专业课程的比重不够和谐，往往容易造成专业课程稀少，一般课程较多的现象，不利于学生专业能力的提高；学生数量不稳定，每年的招生计划不够稳定，这必然不利于对人才的培养；在就业上，由于学生素质、教学质量、教学体系的不够完善，使得就业也成为了一大问题。
2.教学理论与实践矛盾突出
在教学中出现的另外一个问题是教学理论与教学实践的严重脱节。教学与实践脱节、教师与实践脱节、课程设置与实践脱节等现象的产生，使教学秩序混乱，理论化过于严重，实践性很差，这必然不利于学生本身的成长。可见，理论和实践的突出矛盾是影响教学改革的突出因素。
3.教师考核方式不灵活阻碍教学转型
教师的考核方式不灵活也阻碍了教学改革及院校的转型。在很多的考核中，考核方式单一模式化，这在很大程度上影响了教师主动性的发挥和创造力的培养，抑制了教师的活力和激情。目前对教师的主要考核方式还停留在对单纯的课堂讲授、教案等纯理论上的考核，在教师职称的评定方面也是唯科研项目和是好，所谓教学成绩的评定也是纯纸面上的指标。单一的考核方式让很多教师不得不去为了应付相应的“政策”做一些无用功，很少有自己的精力和时间去研究教学，无法和学生展开深入探讨和分析，这对于教学实践和教学改革是相当不利的，只有加速教学改革，深入院校的教学转型，才能够不断地提高教学质量，为国家和社会培养出更多优秀人才。
4.学生的综合能力无法满足教学改革的需要
学生的综合能力无法满足教学改革的需要是一些院校转型过程中面临的重要问题。由于学生是所有教学活动的主要力量，学生的参与是教学活动的根本。学生缺乏能动性和动手能力与创造力等问题严重影响到了教学的改革。如果学生的综合素质无法满足教学改革的条件，那么所有的教学转型和教学改革将不能得到深入开展和实践。我们要清楚地看到，学生缺乏能动性和创造力的根本原因所在，归根结底是我们的教学体系、制度存在不少问题。所谓“一代新人赶旧人”，我们要始终相信学生的潜力是客观存在的，关键是看培养机构有没给他们提供发挥潜能的机会与平台。因此，要想实践生物工程专业教学改革和院校的有机转型，就必须首先提高学生的主观能动性和动手能力，提高他们的潜在素质，提高他们的根本实力，适应教学改革。
三、如何实现地方院校生物工程专业教学的改革及转型
1.学校加强顶层设计，从整体上把握改革方向
实现生物工程专业教学的改革和院校教学转型，首先要站在学校的立场加强顶层设计，从整体上把握教学改革的方向。广泛听取学生、教师、和社会需求的呼声，在管理制度，对教师考核晋级，对学生学习效果的考核方式、培养与就业模式等方面做出制度性的改变。改变传统、落后的教学形式和管理制度，站在人性化的立场进行分析，结合时代的要求和素质教育改革的根本需要来确定改革的方向，科学、理性地把握改革目标，力求实现成功的教育转型。
2.彻底改变课程设置与教学模式
要彻底改变原有的，不合理的课程设置方式和教学模式，调整理论课和实践课的比例，不断地强化素质教育，特别是对生物工程专业来说，要逐步改变重理论课、轻实验课，重闭卷理论考试轻动手操作、设计能力，重课堂轻社会实践等种种弊端。建议大学学习全程开展理论占三分之一、实验课三分之一、工程实习三分之一的时间分配的教学模式，不断强化实践课的学习，在这个过程中不断地增强学生的动手能力和实际操作能力，提高他们的创新能力和思维能力，只有这样才能够让学生在以后的人生走得更远。
3.加快师资结构与教师队伍的转型
加速师资结构的调整和教师队伍的转型，首先要考虑不断地聘请科研一线、生产一线、管理一线资深人员进课堂讲课，培养理论实践结合型教师队伍；其次，加强对在编教师的引导和时间能力的培训，尤其是对年轻教师的引导和培训，他们充满激情与活力，精力充沛，干劲十足，要鼓励他们多下企业，沉到生产一线，打造一批精干的实践与理论结合型教师队伍。这首先需要学校从对教师的评价制度方面进行引导，这样才能真正凑效。对于那些多年来一直以理论教学为主的老师，应该让他们继续开展理论教学活动，因为要改变他们往往较为困难。对于年轻的教师来说，要加强对他们的重点培训，让他们在懂理论的基础之上增强自己的实践能力和动手能力，不断地提高他们自身的素质。只有这样，他们在教学中才能够做到游刃有余，为学生进行有效指导，从而提高学生的学习效果，促使他们进步和成长。
4.学校加强学生实践基地建设
生物工程专业对学生的动手能力和实践能力都有很高的要求，因此，要想增强学生的实践能力，可以加强学生实践基地的建设来实现。就学校而言，可以与社会上的企业进行合作，让学生有地方实习，有机会练手，或者可以定期组织学生到相关的单位进行学习和锻炼，不断地强化学生的实践能力。不仅如此，学校也可以增设实验室，给予学生充足的课外空间，给他们足够的实践机会进行学习和锻炼。总而言之，只有加强学生的实践能力，才能够从根本上促进他们成长，为他们以后的工作打下良好的基础。
5.改革对教师的评价方式
教师是教学活动的中坚力量和灵魂所在，要改变传统错误的教师评价方式，尤其要改革职称评审中重课题、论文和课堂教学的纯理论式的评价方式，从评价机制上激发教师转型的积极性。这势必存在一定的困难，因为职称评定是省一级行政部门主管制定政策，单靠学校很困难。所以很多问题可以探讨，但实施很难。另外，教师也要提升个人的内在自觉，不断地强化他们的软实力，塑造高贵的灵魂和较高的社会责任感，增强个人的责任意识和奉献精神。总之，要善于从多方面来加强对于教师的培养，不断地进行师资的整顿和教育，只有这样才能够促使教学以更加积极健康的姿态成长，培养更多优秀的人才，为国家和社会贡献自己的力量。
四、结语
“卓越工程师培养计划”是适应我国工业化发展进程，培养和造就一大批创新能力强、适应我国经济社会发展需要的工程技术人才的重要举措，是增强我国核心竞争力、建设创新型国家、走新型工业化道路的必然选择[2]。实施“卓越工程师教育培养计划”，将进一步丰富我校的产学合作教育模式内涵，提升它的品牌效应。实施“卓越工程师教育培养计划”也将使我校的办学特色更为鲜明，两者是相互促进的。我们将紧紧抓住这次机遇，按照“卓越工程师”的要求，整体设计人才培养方案，科学制定培养“卓越工程师”的通用标准和行业标准，深入研究理论与实践课程教学大纲，强化校企实习实训基地建设，强化“双师型”师资队伍建设，建立相应的配套政策和建立质量保障体系，以最大的工作热情确保“卓越工程师教育培养计划”在我校实施成功。为此，我院按照学校要求积极组织实施“卓越工程师教育培养计划”的设计方案。为积极贯彻落实学校在人才培养和学科建设上“顶天立地”的战略目标，学院经过几年的不懈努力与探索，在人才培养模式、效果上大力进行创新。以培养高素质应用型创新人才为指导目标，产学研结合，走出了我院依托科研发展，教学科研良性互动，提升教育教学质量的新路子，在取得了显著的建设成就同时为实施“卓越工程师教育培养计划”奠定了坚实基础。
二、改革具体措施
1.坚持以教学为中心，科研促进教学。科研是大学活力的源泉，以科研促进教学是提高大学教学质量的重要途径[3]。科学研究不仅可以增强教学的深度、拓展教学的广度，而且可以更新教师知识结构、完善教师的知识体系，提高教学效果。高校教师既要从事教学，又要进行科研，要将二者有机结合，以科研促进教学。我院提出了以行业产业为导向的生物工程卓越工程师培养模式。在培养应用型创新人才的办学定位基础上，以教学为中心，根据经济社会发展需求和自身条件、发展潜力，继承办学传统，不断深化人才培养模式改革，明确了“坚持立足地方、依托地方、服务地方的办学方针，依托四川及成都市现代生物产业，坚持以生物产业发展对人才的需求为导向”的办学理念。我院坚持以现代产业发展对人才需求为导向，构建了以产学研战略联盟为平台，学科链、专业链对接产业链的办学模式。已在全院范围内努力营造了“产学合作、工学交替”的良好氛围。使“以教学为中心，科研促进教学”成为学院的共识和自觉行为。
2.强化培养学生的工程能力和创新能力。我们将具备一定专业知识并能运用所学知识完成工程项目的能力称为工程能力。就目前社会所需来看，我们的学生在这方面还存在着巨大的不足。因此，强化培养学生的工程能力有助于他们今后在走入工作岗位时更好地解决实际困难。例如，在实践环节方面，围绕学生的工程实践能力的提高，尽力运用校内外资源，为学生设置工程实践与锻炼环节。通过生产实习，帮助学生建立专业与工程的概念。大力培养学生的动手能力，尤其重视对学生实验技能的培养，越是基础的实验要求越严格越规范，做到让每一位学生都能带着严谨的态度操作每一个实验项目。强化创新能力是人才培养中的一个重要内容，是科技活动的灵魂。在科技活动中培养学生的创新能力至关重要[4]。鼓励教师在教学方法上做出一定的创新，通过与学生之间的互动，将创新思想引入课堂，激发学生的创新意识，从而启发学生的创新思维，最终树立起自己的创新观点。运用创新的教学模式，例如通过多媒体形式将世界最新科技引入课堂，组织一场针对最新科技的讨论，让学生像参与者一样体会整个项目的策划实施。
3.通过激发兴趣，培养学生综合素质和社会责任感。兴趣是学习最好的老师，一旦我们对某种事物产生了兴趣我们就会全身心投入进去，不断探索，不断求知。因此兴趣的培养是“卓越工程师教育培养计划”中的一项重要内容。为充分培养学生的兴趣，首先我们要先启发他们对事物的兴趣，老师可以通过在课堂教学时不断跟同学互动，增进学生对新知识的渴望，把他们引进门后鼓励他们参加各类科研知识讲座、参加科创活动，并在其中不断指导等。设置个性化实验室、简历实验室开放中和实验室竞赛等，着力培养浓厚的学习与研究兴趣，并促使学生进行“兴趣———行动”的转变[5]。
除了授课过程中“与时倶进”地讲授最新的研究进展和科技前沿知识外，我们在教学实践中根据本课程的教学内容和教学特点，设置或鼓励学生自己寻找与教学目标和教学要求相适应的、注重理论研究和解释实际的课程论文题目，引导学生尝试探索某个知识点的历史起因、研究现状和前景展望，激发其学习兴趣和求知欲望，取得了较好的教学效果。
一、设置课程论文及答辩的重要性
通过调查，选择生物工程基础课程的学生来自各个专业，知识面背景不同，有不少学生从未接触过相关领域的课程，许多是怀着好奇心理来上这门课的，还有的学生只是单纯地来混混学分，被动来听课的。在这种情况下，教师必须要抓住学生的学习兴趣和求知欲望，否则课堂气氛不好，学习风气不理想，会导致教学效果不佳。因此，必需摒弃传统的教师讲、学生听的缺乏互动的教学模式，因为这种模式无助于学生独立思考和动手的素质及其能力的形成。
设置课程论文及答辩进行教学或者考核，能够成为培养学生独立思考判断能力跨出的第一步，也是重要的一步。重要的是培养学生思考和判断的能力，所以考核学生的成绩主要看学生是否能独立查阅文献、认真思考，并且言之成理地写出来，结论即使稍有偏颇也是允许的。同时，学生只有具备独立的思考判断能力和获取知识的能力，才能在终身教育过程中面对日新月异的世界，不断实现知识的更新，实现从学会知识到学会学习的飞跃。
二、课程论文及答辩的实施方式
(一)课程论文选题
选题是开展研究的第一步，直接决定着课程论文的质量和结果。因此，我们在教学过程中，注意理论联系实际，有意识地介绍本课程相关研究领域的热点问题和前沿研究动态，启发学生对问题的思考，培养研究性学习方法。学生根据自己的思考和兴趣，将自己的选题范围报上来，经过筛选和课堂讨论，确定最终的课程论文选题和目标。通过这种方式，学生会感到自己受到了重视，并且会将课堂所学理论知识和自己的生活实践与思考心得结合起来，满怀信心和热情地投入到选题后的研究中去。
(二)查阅文献
教师要让学生明白“不查文献不做学问”的重要性，要求学生广泛地阅读相关书目查找各种资料，并进行仔细地分析、辨别，使知识和能力趋向统一。要把某个问题讲清楚，学生必须综合运用该课程或其他课程所学过的基本理论和基础知识。学生须熟练掌握利用图书馆、网络资源查阅国内外某个研究问题的过去、现在和将来的本领，贴”。只有充分地了解了前人的工作，才能胸有成竹地撰写自己的课程论文。
(三)课程论文撰写
因为许多大学生没有撰写课程论文的经验。我们在教学过程中会拿出几篇撰写规范的论文给学生讲评，告之如何将所见所想用科技论文语言来表述，如何安排符合逻辑思维的论文结构和层次，甚至逐词逐句地帮学生确定题目、摘要、关键词、段落层次和结论的书写，从而培养学生严谨的研究表达思维，锻炼初步的论文撰写能力。另外，教师也会将那些不规范的论文展示给学生看，结合历史上因为论文不规范而科研失败的实例，让学生懂得细节的重要性，写出比较规范的课程论文来。
(四）论文评价和交流
学生要想写好自己的论文，必须经过课堂的讨论和交流，对比差距，查找缺漏，更好地完善自己的课程论文。任课教师一定要注意导向，这对保护学生的学习热情和端正态度很重要，因此就不应该轻易地否定某一个同学的研究工作。如果他确有缺点和不足，教师要提出改进的措施和方式，让学生意识到错误的所在，对进一步的修改进有清晰的认识。同时，教师还应积极引导学生自己评自己，通过传阅其他同学的论文，客观评价自己，交流心得，做到知己知彼，不断提高自己。
(五)课程论文答辩
论文答辩是课程论文的重要一环。良好的语言表达能力和沟通能力会让学生将自己的课程论文成绩展现给大家看。这要求学生精心准备材料、课件和图片，努力在限定时间内将自己复杂枯燥的研究用简单热情的语言表达出来，富有感染力地激发听众兴趣。答辩过程中，更考查学生对知识的掌握能力和认知深度，鼓励其他学生都来当答辩委员会成员，只要与课程论文有关的问题都可以提出来，以此活跃课堂气氛，深化理论学习。教师的点评很重要，应从论文的选题质量、论文的理论性与科学性、论文的写作水平、论文答辩表现4个方面进行评价，做到公正和公平，又不失趣味性。
三、设置课程论文及答辩的教学效果
(一)调动了学生学习积极性
这一点最值得一提。学生充分发挥了自己的学习热情后，在选题过程中，许多学生就会将目光投向当前研究比较热点的胚胎干细胞、转基因食品、克隆技术、发酵产业等。特别是2007年11月最新的诺贝尔生理或医学奖揭晓后，学生对获奖领域的“胚胎干细胞和哺乳动物DNA重组”内容产生了浓厚兴趣，我们在教学过程中，抓住这一点，对细胞工程和胚胎干细胞工程理论进行了详细地讲述，引导学生主动查阅和搜集相关文献资料，了解这一生物工程的前沿进展。在确定选题时，就有学生将重点放在了胚胎干细胞的伦理道德方面，建议开发其他组织代替胚胎开展干细胞研究。而在2007年11月20日日本和美国有两个研究小组成功地将人皮肤诱导为类干细胞后，有学生喜出望外地打电话告诉我，仿佛这一研究成果是他做出来一样，由此可见学生的积极性有多高。
(二）启发了学生和教师今后的研究
教学相长，这一点在通过课程论文及答辩的教学尝试中得到了体现。很多时候，任课教师由于长年的教学或科研，思路比较受局限。在做课程论文及答辩的进程中，教师因和学生一起探索了某个科研进展，从而激发了许多新的研究思路，为课程教学注入了新鲜的活力。比如，从细胞融合技术上，有学生结合自己玩网络游戏的经历，提出了“人兽杂交”的选题，并通过深入调研，总结了人兽杂交的历史背景、研究意义和进展，既很吸引眼球，也对这一领域的发展趋势和监管方面提出了许多独到的见解，值得教师和其他学生深入思考和研究。
(三)提高学生的综合素质
撰写课程论文是提高学生综合素质的有效途径。课题选择过程中，学生广泛阅读，能増强其发现和提出问题的能力；搜集信息、资料利用的过程，能提高其掌握文献检索的能力、计算机应用能力、社会交往的能力；解释资料的过程能锻炼学生的理论联系实际、综合分析、抽象概括的能力；撰写论文和论文交流答辩的过程能提高学生的写作能力、语言表达能力、归纳总结能力。学生参加了答辩后，认为自己敢于在大家面前表达自己的观点了，这对于其将来提高演讲能力、普及科学知识、参加毕业答辩都有良好的助益。
在生产流程中,为了减少污染物排放、甚至零排放,可以利用生物工程技术,研制具有特别功能的“工程菌”或“工程细胞株”,例如,在农业领域使用生物农药无毒、安全、无污染等;利用生物质能源能极大降低污染物排放;高催化效率“工程菌”加快化学反应,使生产过程能源、原料的消耗降低;综上所述,生物工程技术对于生态环境保护意义重大。
2生物工程在环境监测的应用
环境保护工作中的一个重要环节就是监测环境污染,应用化学仪器分析以及生物监测是环境监测的重要方法。可以利用基因工程技术改造过的微生物、指示生物、生物芯片技术、生物传感器技术、分子生物学等技术监测环境污染。近年来,环境监测也可以通过研究较多的有聚合酶式反应技术(PCR技术)、酶联免疫吸附技术(ELISA)、核酸探针、生物传感器、生物荧光方法等生物高新技术。土壤、沉积物、水样等环境标本的细胞检测可以通过PCR技术完成。水体中的BOD、酚、NO3、有机磷,以及大气中的CO2、SO2、NOx的含量及浓度分析都可以用生物传感技术测定。今后,由于其快速、灵敏、特异性强的特性,生物工程技术将在环境监测中广泛应用。
3生物工程在废水处理中的应用
需要一个由多种方法组成的多层次处理系统将废水中所含的多种污染物质处理。预处理多为物理方法,化学方法容易产生二次污染;利用生物的新陈代谢作用,对废水中的污染物质进行转化和稳定,将废水中污染物转化为无毒、无害、稳定的物质,这种方法就是利用生物工程措施在废水净化中的应用。固定化微生物技术。利用基因工程技术将一些具有特异性的优势菌种不断得到改造或创造,将这些具有脱色菌、脱氮、脱磷等高效专性菌进行固定化后,菌体密度提高,这种技术应用于废水处理,有利于提高生物反应器内微生物(尤其是特殊功能的微生物)的浓度,有利于微生物抵抗不利环境的影响,有利于反应后的固液分离,缩短处理所需的时间。生物反应器技术。在活性污泥中加入固定载和流动载体,以及好氧和厌氧固定膜的反应器,极大的增加了反应体系中的生物量和生物类群,运用发酵工程原理,使得微生物降解污染物的生物活性得到最大化的发挥。此法处理效率高、出水水质好;设备紧凑、占地面积小;易实现自动控制、运行管理简单。生物强化处理技术。通过向传统的生物处理系统中引入具有特定功能的微生物,提高有效微生物的浓度,增强对难降解有机物的降解能力,提高其降解速率,并改善原有生物处理体系对难降解有机物的去除效能。在水污染治理中的应用主要有:治理高浓度有机废水;有毒、有害难降解污染物的治理;脱氮除磷等。
4应用生物工程技术处理固体废弃
物固体垃圾处理通过物理的手段(如粉碎、压缩、干燥、蒸发、焚烧等)或生物化学作用(如氧化、消化分解、吸收等)用以缩小其体积、加速其自然净化的过程。焚烧、填埋等常规处理方式不能从根本上解决污染问题,污泥直接焚烧的热值过低,还要治理有害气体、粉尘污染,污泥焚烧的一次性投资和运行成本过高,采用现代生物技术处理这些有机物,把有机废弃物发酵成为有机肥或营养土去肥沃土地,再把植物变成食物,这是适应大自然自身规律的一种处理和循环利用方式。生物工程技术在消除白色污染方面意义重大,主要表现为:(1)通过基因工程技术可筛选优势微生物、构建高效降解菌,并通过发酵工程技术大量培养,可使白色污染物得到降解。(2)利用基因工程技术将能编码降解蛋白的基因导入某一土壤微生物中,使他们共同发挥各自的功能和作用,迅速将塑料等白色污染物降解。
5应用生物工程治理大气污染废气
的生物处理和空气净化是一种利用微生物吸附分解有机物能力和降解恶臭物质与有机废物的方法,主要方法有生物洗涤、生物过滤、生物吸附法等。这些方法具有成本低、效率高、安全性好和无二次污染等优点。
6应用生物工程治理土壤污染土壤污染
