胡麻SUC基因家族的鉴定与生物信息学分析

作者:齐燕妮; 李闻娟; 王利民; 赵玮; 党照; 谢亚萍; 张建平 甘肃省农业科学院作物研究所; 甘肃兰州730070

摘要:利用多个物种的SUC基因蛋白序列在胡麻基因组内进行BlastP分析,通过Pfam确认结构域,获得胡麻SUC基因家族成员,并进行基因结构分析;对蛋白分子量、等电点、信号肽、跨膜结构域、糖基化修饰位点、亚细胞定位、Motif及二级结构进行预测。结果鉴定得到12个胡麻SUC基因家族成员,大部分成员含有4个以上的外显子,10个以上跨膜结构域,并获4个特征性Motif。进化树分析显示,胡麻SUC分别属于SUT1、SUT2和SUT4家族。

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国际刊号:1001-1463

国内刊号:62-1050/S

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